距离天人与人类联盟军的决战已过去四年，天人组织一度消失，世界由三大国家联盟统一为联合政府。然而这仅是表象，军方秘密组织A-LAWS暗中武装镇压一切反对势力，人类仍未摆脱纷争与矛盾。此时天人组织再度回归，驾驶员刹那·F·清英驾驶新型高达00展开武力介入。他们不仅要对抗A-LAWS的机动战士部队，还需面对神秘组织“变革者”——其首领里冯兹正策划着更为庞大的阴谋。

播出信息： 机动战士高达00第二季2008年10月5日在日本首播，全25集，现已完结。

拍摄制作： 机动战士高达00第二季由日升动画制作，继承第一季制作班底，以“战争的本质与人类的相互理解”为核心主题，在第一季的基础上拓展了世界观格局，深化了对统一世界下隐性压迫的探讨。

幕后花絮：本作为《机动战士高达00》系列的电视动画第二季，接档第一季剧情，播出时间为2008年10月，全片共25集，每集时长25分钟。；作品沿用了第一季核心主创阵容，黑田洋介担任编剧，水岛精二担任总导演，保留了第一季全部核心声优。；作品结尾为后续剧场版《机动战士高达00：先驱者的觉醒》埋下了剧情伏笔。

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